Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frem2Q6NVD0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frem2Q6NVD0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frem2Q6NVD0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frem2Q6NVD0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frem2Q6NVD0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frem2Q6NVD0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frem2Q6NVD0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frem2Q6NVD0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frem2Q6NVD0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frem2Q6NVD0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frem2Q6NVD0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frem2Q6NVD0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frem2Q6NVD0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frem2Q6NVD0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frem2Q6NVD0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frem2Q6NVD0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frem2Q6NVD0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frem2Q6NVD0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frem2Q6NVD0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frem2Q6NVD0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frem2Q6NVD0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frem2Q6NVD0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms