Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Hecw2Q6I6G8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Hecw2Q6I6G8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Hecw2Q6I6G8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Hecw2Q6I6G8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Hecw2Q6I6G8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Hecw2Q6I6G8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Hecw2Q6I6G8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Hecw2Q6I6G8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Hecw2Q6I6G8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Hecw2Q6I6G8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Hecw2Q6I6G8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Hecw2Q6I6G8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Hecw2Q6I6G8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Hecw2Q6I6G8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Hecw2Q6I6G8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Hecw2Q6I6G8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Hecw2Q6I6G8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Hecw2Q6I6G8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Hecw2Q6I6G8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Hecw2Q6I6G8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Hecw2Q6I6G8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Hecw2Q6I6G8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Hecw2Q6I6G8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Hecw2Q6I6G8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Hecw2Q6I6G8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Hecw2Q6I6G8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Hecw2Q6I6G8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Hecw2Q6I6G8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Hecw2Q6I6G8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Hecw2Q6I6G8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Hecw2Q6I6G8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Hecw2Q6I6G8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Hecw2Q6I6G8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Hecw2Q6I6G8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Hecw2Q6I6G8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Hecw2Q6I6G8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Hecw2Q6I6G8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Hecw2Q6I6G8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Hecw2Q6I6G8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Hecw2Q6I6G8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Hecw2Q6I6G8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Hecw2Q6I6G8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Hecw2Q6I6G8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Hecw2Q6I6G8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Hecw2Q6I6G8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Hecw2Q6I6G8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Hecw2Q6I6G8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Hecw2Q6I6G8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Hecw2Q6I6G8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Hecw2Q6I6G8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Hecw2Q6I6G8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Hecw2Q6I6G8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Hecw2Q6I6G8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Hecw2Q6I6G8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Hecw2Q6I6G8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.46
Hecw2Q6I6G8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Hecw2Q6I6G8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Hecw2Q6I6G8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Hecw2Q6I6G8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Hecw2Q6I6G8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Hecw2Q6I6G8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Hecw2Q6I6G8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Hecw2Q6I6G8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Hecw2Q6I6G8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Hecw2Q6I6G8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms