Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Smarca2Q6DIC0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Smarca2Q6DIC0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Smarca2Q6DIC0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Smarca2Q6DIC0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Smarca2Q6DIC0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC44.77■■■■■ 4.76
Smarca2Q6DIC0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Smarca2Q6DIC0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
Smarca2Q6DIC0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
Smarca2Q6DIC0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Smarca2Q6DIC0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Smarca2Q6DIC0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Smarca2Q6DIC0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Smarca2Q6DIC0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Smarca2Q6DIC0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Smarca2Q6DIC0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Smarca2Q6DIC0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.74
Smarca2Q6DIC0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.74
Smarca2Q6DIC0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Smarca2Q6DIC0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Smarca2Q6DIC0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
Smarca2Q6DIC0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Smarca2Q6DIC0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Smarca2Q6DIC0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Smarca2Q6DIC0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.63■■■■■ 4.73
Smarca2Q6DIC0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Smarca2Q6DIC0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Smarca2Q6DIC0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Smarca2Q6DIC0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Smarca2Q6DIC0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Smarca2Q6DIC0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
Smarca2Q6DIC0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
Smarca2Q6DIC0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
Smarca2Q6DIC0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Smarca2Q6DIC0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Smarca2Q6DIC0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Smarca2Q6DIC0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Smarca2Q6DIC0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Smarca2Q6DIC0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Smarca2Q6DIC0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Smarca2Q6DIC0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Smarca2Q6DIC0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Smarca2Q6DIC0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Smarca2Q6DIC0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Smarca2Q6DIC0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Smarca2Q6DIC0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Smarca2Q6DIC0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Smarca2Q6DIC0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Smarca2Q6DIC0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Smarca2Q6DIC0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Smarca2Q6DIC0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Smarca2Q6DIC0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Smarca2Q6DIC0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Smarca2Q6DIC0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Smarca2Q6DIC0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Smarca2Q6DIC0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Smarca2Q6DIC0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Smarca2Q6DIC0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Smarca2Q6DIC0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Smarca2Q6DIC0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Smarca2Q6DIC0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
Smarca2Q6DIC0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Smarca2Q6DIC0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Smarca2Q6DIC0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Smarca2Q6DIC0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Smarca2Q6DIC0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Smarca2Q6DIC0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.66
Smarca2Q6DIC0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Smarca2Q6DIC0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Smarca2Q6DIC0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
Smarca2Q6DIC0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
Smarca2Q6DIC0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Smarca2Q6DIC0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Smarca2Q6DIC0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
Smarca2Q6DIC0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Smarca2Q6DIC0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Smarca2Q6DIC0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Smarca2Q6DIC0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
Smarca2Q6DIC0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Smarca2Q6DIC0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Smarca2Q6DIC0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Smarca2Q6DIC0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Smarca2Q6DIC0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC43.95■■■■■ 4.63
Smarca2Q6DIC0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Smarca2Q6DIC0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms