Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

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Length 1,940 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kiaa1549Q68FD9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kiaa1549Q68FD9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kiaa1549Q68FD9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kiaa1549Q68FD9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kiaa1549Q68FD9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kiaa1549Q68FD9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kiaa1549Q68FD9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kiaa1549Q68FD9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kiaa1549Q68FD9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kiaa1549Q68FD9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kiaa1549Q68FD9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kiaa1549Q68FD9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kiaa1549Q68FD9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kiaa1549Q68FD9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kiaa1549Q68FD9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kiaa1549Q68FD9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kiaa1549Q68FD9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kiaa1549Q68FD9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kiaa1549Q68FD9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kiaa1549Q68FD9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kiaa1549Q68FD9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kiaa1549Q68FD9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kiaa1549Q68FD9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kiaa1549Q68FD9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kiaa1549Q68FD9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kiaa1549Q68FD9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kiaa1549Q68FD9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kiaa1549Q68FD9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Kiaa1549Q68FD9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kiaa1549Q68FD9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kiaa1549Q68FD9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kiaa1549Q68FD9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kiaa1549Q68FD9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Kiaa1549Q68FD9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kiaa1549Q68FD9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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