Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9cQ66X01 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9cQ66X01 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp9cQ66X01 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp9cQ66X01 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp9cQ66X01 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp9cQ66X01 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp9cQ66X01 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp9cQ66X01 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp9cQ66X01 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp9cQ66X01 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp9cQ66X01 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nlrp9cQ66X01 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp9cQ66X01 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp9cQ66X01 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp9cQ66X01 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp9cQ66X01 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp9cQ66X01 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp9cQ66X01 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp9cQ66X01 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp9cQ66X01 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp9cQ66X01 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp9cQ66X01 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp9cQ66X01 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nlrp9cQ66X01 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp9cQ66X01 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms