Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pan3Q640Q5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pan3Q640Q5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pan3Q640Q5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pan3Q640Q5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms