Protein–RNA interactions for Protein: Q640N2

Arl13b, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13bQ640N2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arl13bQ640N2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Arl13bQ640N2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arl13bQ640N2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arl13bQ640N2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arl13bQ640N2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arl13bQ640N2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Arl13bQ640N2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arl13bQ640N2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arl13bQ640N2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arl13bQ640N2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arl13bQ640N2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arl13bQ640N2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl13bQ640N2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl13bQ640N2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl13bQ640N2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl13bQ640N2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl13bQ640N2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl13bQ640N2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl13bQ640N2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl13bQ640N2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arl13bQ640N2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arl13bQ640N2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arl13bQ640N2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arl13bQ640N2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms