Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20809Q62458 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20809Q62458 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20809Q62458 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20809Q62458 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20809Q62458 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20809Q62458 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Gm20809Q62458 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20809Q62458 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Gm20809Q62458 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Gm20809Q62458 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20809Q62458 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Gm20809Q62458 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Gm20809Q62458 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Gm20809Q62458 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Gm20809Q62458 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Gm20809Q62458 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20809Q62458 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20809Q62458 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20809Q62458 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20809Q62458 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20809Q62458 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20809Q62458 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20809Q62458 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20809Q62458 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20809Q62458 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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