Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Supt6hQ62383 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Supt6hQ62383 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Supt6hQ62383 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Supt6hQ62383 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Supt6hQ62383 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Supt6hQ62383 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Supt6hQ62383 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Supt6hQ62383 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Supt6hQ62383 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Supt6hQ62383 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Supt6hQ62383 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Supt6hQ62383 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Supt6hQ62383 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Supt6hQ62383 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Supt6hQ62383 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Supt6hQ62383 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Supt6hQ62383 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Supt6hQ62383 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Supt6hQ62383 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Supt6hQ62383 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Supt6hQ62383 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Supt6hQ62383 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Supt6hQ62383 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Supt6hQ62383 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Supt6hQ62383 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Supt6hQ62383 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Supt6hQ62383 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Supt6hQ62383 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Supt6hQ62383 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Supt6hQ62383 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Supt6hQ62383 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Supt6hQ62383 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Supt6hQ62383 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Supt6hQ62383 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Supt6hQ62383 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Supt6hQ62383 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Supt6hQ62383 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Supt6hQ62383 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Supt6hQ62383 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Supt6hQ62383 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Supt6hQ62383 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Supt6hQ62383 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Supt6hQ62383 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Supt6hQ62383 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Supt6hQ62383 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Supt6hQ62383 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Supt6hQ62383 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Supt6hQ62383 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Supt6hQ62383 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Supt6hQ62383 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Supt6hQ62383 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Supt6hQ62383 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Supt6hQ62383 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Supt6hQ62383 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Supt6hQ62383 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Supt6hQ62383 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Supt6hQ62383 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Supt6hQ62383 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Supt6hQ62383 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Supt6hQ62383 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Supt6hQ62383 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Supt6hQ62383 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Supt6hQ62383 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Supt6hQ62383 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Supt6hQ62383 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Supt6hQ62383 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Supt6hQ62383 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Supt6hQ62383 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Supt6hQ62383 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Supt6hQ62383 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Supt6hQ62383 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Supt6hQ62383 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Supt6hQ62383 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Supt6hQ62383 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Supt6hQ62383 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms