Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
Kdm5dQ62240 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
Kdm5dQ62240 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC47.9■■■■■ 5.26
Kdm5dQ62240 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
Kdm5dQ62240 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
Kdm5dQ62240 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
Kdm5dQ62240 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.25
Kdm5dQ62240 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Kdm5dQ62240 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Kdm5dQ62240 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC47.81■■■■■ 5.24
Kdm5dQ62240 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC47.8■■■■■ 5.24
Kdm5dQ62240 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Kdm5dQ62240 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC47.77■■■■■ 5.24
Kdm5dQ62240 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
Kdm5dQ62240 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC47.76■■■■■ 5.24
Kdm5dQ62240 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC47.76■■■■■ 5.24
Kdm5dQ62240 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
Kdm5dQ62240 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
Kdm5dQ62240 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC47.76■■■■■ 5.24
Kdm5dQ62240 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC47.74■■■■■ 5.23
Kdm5dQ62240 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
Kdm5dQ62240 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
Kdm5dQ62240 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Kdm5dQ62240 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Kdm5dQ62240 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Kdm5dQ62240 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
Kdm5dQ62240 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
Kdm5dQ62240 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
Kdm5dQ62240 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
Kdm5dQ62240 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC47.7■■■■■ 5.23
Kdm5dQ62240 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
Kdm5dQ62240 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
Kdm5dQ62240 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC47.66■■■■■ 5.22
Kdm5dQ62240 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC47.65■■■■■ 5.22
Kdm5dQ62240 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Kdm5dQ62240 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
Kdm5dQ62240 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
Kdm5dQ62240 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.6■■■■■ 5.21
Kdm5dQ62240 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Kdm5dQ62240 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
Kdm5dQ62240 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC47.56■■■■■ 5.2
Kdm5dQ62240 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
Kdm5dQ62240 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC47.52■■■■■ 5.2
Kdm5dQ62240 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
Kdm5dQ62240 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Kdm5dQ62240 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Kdm5dQ62240 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Kdm5dQ62240 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC47.5■■■■■ 5.19
Kdm5dQ62240 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
Kdm5dQ62240 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
Kdm5dQ62240 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
Kdm5dQ62240 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
Kdm5dQ62240 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC47.42■■■■■ 5.18
Kdm5dQ62240 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
Kdm5dQ62240 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
Kdm5dQ62240 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
Kdm5dQ62240 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
Kdm5dQ62240 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.17
Kdm5dQ62240 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC47.36■■■■■ 5.17
Kdm5dQ62240 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC47.35■■■■■ 5.17
Kdm5dQ62240 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
Kdm5dQ62240 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC47.34■■■■■ 5.17
Kdm5dQ62240 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
Kdm5dQ62240 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
Kdm5dQ62240 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
Kdm5dQ62240 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
Kdm5dQ62240 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
Kdm5dQ62240 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
Kdm5dQ62240 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
Kdm5dQ62240 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
Kdm5dQ62240 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
Kdm5dQ62240 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
Kdm5dQ62240 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
Kdm5dQ62240 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
Kdm5dQ62240 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
Kdm5dQ62240 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
Kdm5dQ62240 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC47.2■■■■■ 5.15
Kdm5dQ62240 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC47.15■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC47.15■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC47.15■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC47.15■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Kdm5dQ62240 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC47.12■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms