Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Six1Q62231 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Six1Q62231 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Six1Q62231 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Six1Q62231 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Six1Q62231 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Six1Q62231 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Six1Q62231 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Six1Q62231 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Six1Q62231 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Six1Q62231 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Six1Q62231 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Six1Q62231 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Six1Q62231 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Six1Q62231 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Six1Q62231 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Six1Q62231 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Six1Q62231 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Six1Q62231 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Six1Q62231 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Six1Q62231 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Six1Q62231 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Six1Q62231 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six1Q62231 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six1Q62231 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six1Q62231 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Six1Q62231 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Six1Q62231 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Six1Q62231 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Six1Q62231 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Six1Q62231 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Six1Q62231 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Six1Q62231 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Six1Q62231 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Six1Q62231 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Six1Q62231 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Six1Q62231 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Six1Q62231 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Six1Q62231 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Six1Q62231 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Six1Q62231 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Six1Q62231 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Six1Q62231 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Six1Q62231 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Six1Q62231 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Six1Q62231 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Six1Q62231 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Six1Q62231 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Six1Q62231 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Six1Q62231 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Six1Q62231 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Six1Q62231 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Six1Q62231 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Six1Q62231 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Six1Q62231 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Six1Q62231 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Six1Q62231 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Six1Q62231 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Six1Q62231 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Six1Q62231 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Six1Q62231 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Six1Q62231 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Six1Q62231 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Six1Q62231 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Six1Q62231 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Six1Q62231 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Six1Q62231 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Six1Q62231 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Six1Q62231 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Six1Q62231 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Six1Q62231 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Six1Q62231 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Six1Q62231 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Six1Q62231 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Six1Q62231 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Six1Q62231 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Six1Q62231 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Six1Q62231 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Six1Q62231 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Six1Q62231 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Six1Q62231 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Six1Q62231 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms