Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EsrrbQ61539 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EsrrbQ61539 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EsrrbQ61539 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EsrrbQ61539 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EsrrbQ61539 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EsrrbQ61539 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EsrrbQ61539 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EsrrbQ61539 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EsrrbQ61539 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EsrrbQ61539 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EsrrbQ61539 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EsrrbQ61539 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EsrrbQ61539 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EsrrbQ61539 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
EsrrbQ61539 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EsrrbQ61539 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EsrrbQ61539 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EsrrbQ61539 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EsrrbQ61539 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EsrrbQ61539 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EsrrbQ61539 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EsrrbQ61539 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EsrrbQ61539 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EsrrbQ61539 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EsrrbQ61539 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EsrrbQ61539 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EsrrbQ61539 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EsrrbQ61539 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EsrrbQ61539 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EsrrbQ61539 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EsrrbQ61539 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EsrrbQ61539 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EsrrbQ61539 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EsrrbQ61539 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EsrrbQ61539 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EsrrbQ61539 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms