Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itm2aQ61500 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itm2aQ61500 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itm2aQ61500 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itm2aQ61500 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itm2aQ61500 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itm2aQ61500 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itm2aQ61500 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itm2aQ61500 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itm2aQ61500 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itm2aQ61500 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itm2aQ61500 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itm2aQ61500 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itm2aQ61500 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Itm2aQ61500 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itm2aQ61500 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itm2aQ61500 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms