Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsg101Q61187 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsg101Q61187 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsg101Q61187 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsg101Q61187 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsg101Q61187 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tsg101Q61187 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tsg101Q61187 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tsg101Q61187 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsg101Q61187 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsg101Q61187 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsg101Q61187 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tsg101Q61187 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tsg101Q61187 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsg101Q61187 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tsg101Q61187 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tsg101Q61187 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tsg101Q61187 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tsg101Q61187 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsg101Q61187 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsg101Q61187 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsg101Q61187 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsg101Q61187 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tsg101Q61187 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tsg101Q61187 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tsg101Q61187 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tsg101Q61187 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tsg101Q61187 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tsg101Q61187 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tsg101Q61187 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tsg101Q61187 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tsg101Q61187 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tsg101Q61187 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tsg101Q61187 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tsg101Q61187 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tsg101Q61187 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tsg101Q61187 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tsg101Q61187 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tsg101Q61187 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tsg101Q61187 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tsg101Q61187 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tsg101Q61187 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tsg101Q61187 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tsg101Q61187 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tsg101Q61187 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms