Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpc6Q61143 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpc6Q61143 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpc6Q61143 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpc6Q61143 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpc6Q61143 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpc6Q61143 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpc6Q61143 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Trpc6Q61143 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trpc6Q61143 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpc6Q61143 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpc6Q61143 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpc6Q61143 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpc6Q61143 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpc6Q61143 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpc6Q61143 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpc6Q61143 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpc6Q61143 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpc6Q61143 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpc6Q61143 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpc6Q61143 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpc6Q61143 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trpc6Q61143 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trpc6Q61143 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpc6Q61143 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpc6Q61143 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpc6Q61143 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpc6Q61143 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpc6Q61143 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpc6Q61143 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpc6Q61143 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpc6Q61143 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms