Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29,51■■■□□ 2,31
NinQ61043 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
NinQ61043 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
NinQ61043 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
NinQ61043 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
NinQ61043 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
NinQ61043 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
NinQ61043 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
NinQ61043 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
NinQ61043 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29,47■■■□□ 2,31
NinQ61043 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
NinQ61043 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
NinQ61043 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
NinQ61043 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29,43■■■□□ 2,3
NinQ61043 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
NinQ61043 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
NinQ61043 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,42■■■□□ 2,3
NinQ61043 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
NinQ61043 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
NinQ61043 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
NinQ61043 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
NinQ61043 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
NinQ61043 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
NinQ61043 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
NinQ61043 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29,33■■■□□ 2,29
NinQ61043 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
NinQ61043 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29,29■■■□□ 2,28
NinQ61043 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
NinQ61043 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
NinQ61043 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
NinQ61043 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,26■■■□□ 2,28
NinQ61043 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
NinQ61043 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
NinQ61043 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
NinQ61043 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
NinQ61043 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29,25■■■□□ 2,27
NinQ61043 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
NinQ61043 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
NinQ61043 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
NinQ61043 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
NinQ61043 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
NinQ61043 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
NinQ61043 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
NinQ61043 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29,23■■■□□ 2,27
NinQ61043 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
NinQ61043 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
NinQ61043 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
NinQ61043 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,27
NinQ61043 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
NinQ61043 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
NinQ61043 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
NinQ61043 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
NinQ61043 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,26
NinQ61043 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
NinQ61043 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
NinQ61043 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
NinQ61043 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
NinQ61043 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
NinQ61043 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
NinQ61043 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
NinQ61043 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
NinQ61043 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
NinQ61043 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29,15■■■□□ 2,26
NinQ61043 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,14■■■□□ 2,26
NinQ61043 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,13■■■□□ 2,25
NinQ61043 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
NinQ61043 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
NinQ61043 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29,13■■■□□ 2,25
NinQ61043 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
NinQ61043 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29,1■■■□□ 2,25
NinQ61043 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
NinQ61043 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
NinQ61043 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
NinQ61043 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
NinQ61043 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
NinQ61043 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
NinQ61043 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29,07■■■□□ 2,24
NinQ61043 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
NinQ61043 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29,06■■■□□ 2,24
NinQ61043 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
NinQ61043 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
NinQ61043 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
NinQ61043 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
NinQ61043 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
NinQ61043 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
NinQ61043 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
NinQ61043 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
NinQ61043 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
NinQ61043 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
NinQ61043 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
NinQ61043 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
NinQ61043 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
NinQ61043 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
NinQ61043 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
NinQ61043 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
NinQ61043 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
NinQ61043 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
NinQ61043 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
NinQ61043 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
NinQ61043 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms