Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
JrkQ60976 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
JrkQ60976 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
JrkQ60976 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
JrkQ60976 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
JrkQ60976 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
JrkQ60976 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
JrkQ60976 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JrkQ60976 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
JrkQ60976 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
JrkQ60976 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
JrkQ60976 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
JrkQ60976 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
JrkQ60976 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
JrkQ60976 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
JrkQ60976 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
JrkQ60976 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
JrkQ60976 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
JrkQ60976 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JrkQ60976 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JrkQ60976 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JrkQ60976 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
JrkQ60976 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JrkQ60976 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JrkQ60976 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
JrkQ60976 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JrkQ60976 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
JrkQ60976 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JrkQ60976 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
JrkQ60976 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JrkQ60976 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
JrkQ60976 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
JrkQ60976 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
JrkQ60976 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
JrkQ60976 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
JrkQ60976 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
JrkQ60976 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JrkQ60976 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JrkQ60976 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JrkQ60976 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
JrkQ60976 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms