Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rasa3Q60790 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rasa3Q60790 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rasa3Q60790 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rasa3Q60790 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rasa3Q60790 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rasa3Q60790 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rasa3Q60790 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rasa3Q60790 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rasa3Q60790 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rasa3Q60790 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rasa3Q60790 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rasa3Q60790 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rasa3Q60790 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rasa3Q60790 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rasa3Q60790 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rasa3Q60790 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rasa3Q60790 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rasa3Q60790 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rasa3Q60790 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rasa3Q60790 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rasa3Q60790 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rasa3Q60790 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rasa3Q60790 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rasa3Q60790 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rasa3Q60790 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rasa3Q60790 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rasa3Q60790 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rasa3Q60790 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rasa3Q60790 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rasa3Q60790 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rasa3Q60790 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rasa3Q60790 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rasa3Q60790 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rasa3Q60790 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rasa3Q60790 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rasa3Q60790 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rasa3Q60790 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rasa3Q60790 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rasa3Q60790 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rasa3Q60790 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rasa3Q60790 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rasa3Q60790 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rasa3Q60790 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rasa3Q60790 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rasa3Q60790 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rasa3Q60790 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rasa3Q60790 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rasa3Q60790 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rasa3Q60790 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rasa3Q60790 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rasa3Q60790 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rasa3Q60790 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rasa3Q60790 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Rasa3Q60790 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rasa3Q60790 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rasa3Q60790 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rasa3Q60790 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rasa3Q60790 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rasa3Q60790 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rasa3Q60790 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rasa3Q60790 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rasa3Q60790 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rasa3Q60790 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rasa3Q60790 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rasa3Q60790 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rasa3Q60790 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rasa3Q60790 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rasa3Q60790 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rasa3Q60790 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rasa3Q60790 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms