Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PmelQ60696 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PmelQ60696 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PmelQ60696 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PmelQ60696 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PmelQ60696 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PmelQ60696 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PmelQ60696 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PmelQ60696 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PmelQ60696 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PmelQ60696 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmelQ60696 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmelQ60696 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmelQ60696 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmelQ60696 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmelQ60696 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmelQ60696 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmelQ60696 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PmelQ60696 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmelQ60696 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmelQ60696 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmelQ60696 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PmelQ60696 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PmelQ60696 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PmelQ60696 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PmelQ60696 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmelQ60696 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmelQ60696 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PmelQ60696 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PmelQ60696 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PmelQ60696 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PmelQ60696 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PmelQ60696 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PmelQ60696 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PmelQ60696 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PmelQ60696 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PmelQ60696 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PmelQ60696 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PmelQ60696 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PmelQ60696 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PmelQ60696 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PmelQ60696 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PmelQ60696 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PmelQ60696 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms