Protein–RNA interactions for Protein: Q60641

Nr1h4, Bile acid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h4Q60641 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1h4Q60641 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1h4Q60641 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h4Q60641 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h4Q60641 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1h4Q60641 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms