Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf123Q5XPI3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf123Q5XPI3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf123Q5XPI3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rnf123Q5XPI3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rnf123Q5XPI3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rnf123Q5XPI3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rnf123Q5XPI3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rnf123Q5XPI3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rnf123Q5XPI3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rnf123Q5XPI3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rnf123Q5XPI3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rnf123Q5XPI3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rnf123Q5XPI3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rnf123Q5XPI3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rnf123Q5XPI3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf123Q5XPI3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf123Q5XPI3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rnf123Q5XPI3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rnf123Q5XPI3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rnf123Q5XPI3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rnf123Q5XPI3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rnf123Q5XPI3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rnf123Q5XPI3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rnf123Q5XPI3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rnf123Q5XPI3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rnf123Q5XPI3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rnf123Q5XPI3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rnf123Q5XPI3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf123Q5XPI3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf123Q5XPI3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf123Q5XPI3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf123Q5XPI3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rnf123Q5XPI3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rnf123Q5XPI3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rnf123Q5XPI3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rnf123Q5XPI3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnf123Q5XPI3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rnf123Q5XPI3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rnf123Q5XPI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rnf123Q5XPI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rnf123Q5XPI3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rnf123Q5XPI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf123Q5XPI3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf123Q5XPI3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rnf123Q5XPI3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rnf123Q5XPI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rnf123Q5XPI3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rnf123Q5XPI3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rnf123Q5XPI3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rnf123Q5XPI3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rnf123Q5XPI3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rnf123Q5XPI3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rnf123Q5XPI3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnf123Q5XPI3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rnf123Q5XPI3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rnf123Q5XPI3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rnf123Q5XPI3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnf123Q5XPI3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms