Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmn1r195Q5SVD6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r195Q5SVD6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r195Q5SVD6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms