Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I8

Trav3-1, T cell receptor alpha variable 3-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-1Q5R1I8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trav3-1Q5R1I8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav3-1Q5R1I8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav3-1Q5R1I8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms