Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trdv4Q5R1A3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trdv4Q5R1A3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trdv4Q5R1A3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trdv4Q5R1A3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trdv4Q5R1A3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms