Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCM1

Slc17a4, Probable small intestine urate exporter, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a4Q5NCM1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a4Q5NCM1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a4Q5NCM1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a4Q5NCM1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a4Q5NCM1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a4Q5NCM1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a4Q5NCM1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc17a4Q5NCM1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc17a4Q5NCM1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a4Q5NCM1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc17a4Q5NCM1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc17a4Q5NCM1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc17a4Q5NCM1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc17a4Q5NCM1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc17a4Q5NCM1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc17a4Q5NCM1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc17a4Q5NCM1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc17a4Q5NCM1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc17a4Q5NCM1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc17a4Q5NCM1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc17a4Q5NCM1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc17a4Q5NCM1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc17a4Q5NCM1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc17a4Q5NCM1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc17a4Q5NCM1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc17a4Q5NCM1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc17a4Q5NCM1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc17a4Q5NCM1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc17a4Q5NCM1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc17a4Q5NCM1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc17a4Q5NCM1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc17a4Q5NCM1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc17a4Q5NCM1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc17a4Q5NCM1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc17a4Q5NCM1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms