Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trim58Q5NCC9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trim58Q5NCC9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim58Q5NCC9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trim58Q5NCC9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trim58Q5NCC9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim58Q5NCC9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim58Q5NCC9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim58Q5NCC9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim58Q5NCC9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim58Q5NCC9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Trim58Q5NCC9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trim58Q5NCC9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim58Q5NCC9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim58Q5NCC9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim58Q5NCC9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Trim58Q5NCC9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Trim58Q5NCC9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trim58Q5NCC9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trim58Q5NCC9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Trim58Q5NCC9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trim58Q5NCC9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trim58Q5NCC9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trim58Q5NCC9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trim58Q5NCC9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trim58Q5NCC9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trim58Q5NCC9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Trim58Q5NCC9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Trim58Q5NCC9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trim58Q5NCC9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trim58Q5NCC9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trim58Q5NCC9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Trim58Q5NCC9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trim58Q5NCC9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trim58Q5NCC9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Trim58Q5NCC9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trim58Q5NCC9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trim58Q5NCC9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trim58Q5NCC9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trim58Q5NCC9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trim58Q5NCC9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trim58Q5NCC9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trim58Q5NCC9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trim58Q5NCC9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trim58Q5NCC9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trim58Q5NCC9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trim58Q5NCC9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Trim58Q5NCC9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trim58Q5NCC9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trim58Q5NCC9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Trim58Q5NCC9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trim58Q5NCC9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trim58Q5NCC9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trim58Q5NCC9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Trim58Q5NCC9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trim58Q5NCC9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trim58Q5NCC9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trim58Q5NCC9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trim58Q5NCC9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trim58Q5NCC9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trim58Q5NCC9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trim58Q5NCC9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trim58Q5NCC9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trim58Q5NCC9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Trim58Q5NCC9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trim58Q5NCC9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Trim58Q5NCC9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trim58Q5NCC9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trim58Q5NCC9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim58Q5NCC9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim58Q5NCC9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim58Q5NCC9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trim58Q5NCC9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms