Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ecm2Q5FW85 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ecm2Q5FW85 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ecm2Q5FW85 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ecm2Q5FW85 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ecm2Q5FW85 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ecm2Q5FW85 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Ecm2Q5FW85 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ecm2Q5FW85 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ecm2Q5FW85 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ecm2Q5FW85 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ecm2Q5FW85 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Ecm2Q5FW85 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ecm2Q5FW85 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ecm2Q5FW85 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Ecm2Q5FW85 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ecm2Q5FW85 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ecm2Q5FW85 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ecm2Q5FW85 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Ecm2Q5FW85 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ecm2Q5FW85 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ecm2Q5FW85 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Ecm2Q5FW85 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ecm2Q5FW85 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ecm2Q5FW85 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ecm2Q5FW85 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Ecm2Q5FW85 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ecm2Q5FW85 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ecm2Q5FW85 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ecm2Q5FW85 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ecm2Q5FW85 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ecm2Q5FW85 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ecm2Q5FW85 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ecm2Q5FW85 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ecm2Q5FW85 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ecm2Q5FW85 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ecm2Q5FW85 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ecm2Q5FW85 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ecm2Q5FW85 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ecm2Q5FW85 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ecm2Q5FW85 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ecm2Q5FW85 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ecm2Q5FW85 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ecm2Q5FW85 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ecm2Q5FW85 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ecm2Q5FW85 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms