Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sfmbt2Q5DTW2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfmbt2Q5DTW2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sfmbt2Q5DTW2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms