Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chsy3Q5DTK1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chsy3Q5DTK1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chsy3Q5DTK1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chsy3Q5DTK1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chsy3Q5DTK1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 652 ms