Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phactr4Q501J7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Phactr4Q501J7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phactr4Q501J7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phactr4Q501J7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phactr4Q501J7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phactr4Q501J7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phactr4Q501J7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phactr4Q501J7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phactr4Q501J7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phactr4Q501J7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Phactr4Q501J7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phactr4Q501J7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phactr4Q501J7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phactr4Q501J7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phactr4Q501J7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phactr4Q501J7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Phactr4Q501J7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Phactr4Q501J7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phactr4Q501J7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phactr4Q501J7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phactr4Q501J7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phactr4Q501J7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phactr4Q501J7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phactr4Q501J7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms