Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec4Q497M3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec4Q497M3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec4Q497M3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec4Q497M3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec4Q497M3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec4Q497M3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec4Q497M3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec4Q497M3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec4Q497M3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec4Q497M3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec4Q497M3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec4Q497M3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec4Q497M3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec4Q497M3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec4Q497M3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec4Q497M3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms