Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cfap65Q3V0B4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Cfap65Q3V0B4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Cfap65Q3V0B4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Cfap65Q3V0B4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Cfap65Q3V0B4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cfap65Q3V0B4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cfap65Q3V0B4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cfap65Q3V0B4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cfap65Q3V0B4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Cfap65Q3V0B4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cfap65Q3V0B4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cfap65Q3V0B4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cfap65Q3V0B4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cfap65Q3V0B4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cfap65Q3V0B4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cfap65Q3V0B4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cfap65Q3V0B4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cfap65Q3V0B4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cfap65Q3V0B4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Cfap65Q3V0B4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cfap65Q3V0B4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cfap65Q3V0B4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cfap65Q3V0B4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cfap65Q3V0B4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cfap65Q3V0B4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cfap65Q3V0B4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cfap65Q3V0B4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cfap65Q3V0B4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cfap65Q3V0B4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cfap65Q3V0B4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cfap65Q3V0B4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cfap65Q3V0B4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cfap65Q3V0B4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cfap65Q3V0B4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cfap65Q3V0B4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cfap65Q3V0B4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cfap65Q3V0B4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cfap65Q3V0B4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cfap65Q3V0B4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cfap65Q3V0B4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cfap65Q3V0B4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cfap65Q3V0B4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cfap65Q3V0B4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cfap65Q3V0B4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cfap65Q3V0B4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cfap65Q3V0B4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cfap65Q3V0B4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cfap65Q3V0B4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cfap65Q3V0B4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cfap65Q3V0B4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cfap65Q3V0B4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cfap65Q3V0B4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cfap65Q3V0B4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cfap65Q3V0B4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cfap65Q3V0B4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Cfap65Q3V0B4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cfap65Q3V0B4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cfap65Q3V0B4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cfap65Q3V0B4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cfap65Q3V0B4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cfap65Q3V0B4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cfap65Q3V0B4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cfap65Q3V0B4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cfap65Q3V0B4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cfap65Q3V0B4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cfap65Q3V0B4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cfap65Q3V0B4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cfap65Q3V0B4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cfap65Q3V0B4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cfap65Q3V0B4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Cfap65Q3V0B4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Cfap65Q3V0B4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cfap65Q3V0B4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms