Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim80Q3V061 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim80Q3V061 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim80Q3V061 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim80Q3V061 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim80Q3V061 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim80Q3V061 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim80Q3V061 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim80Q3V061 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim80Q3V061 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim80Q3V061 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim80Q3V061 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim80Q3V061 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim80Q3V061 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim80Q3V061 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim80Q3V061 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim80Q3V061 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim80Q3V061 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim80Q3V061 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim80Q3V061 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim80Q3V061 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim80Q3V061 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim80Q3V061 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim80Q3V061 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim80Q3V061 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms