Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3UZV7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UZV7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UZV7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UZV7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3UZV7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3UZV7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UZV7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UZV7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UZV7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UZV7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UZV7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UZV7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UZV7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UZV7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UZV7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UZV7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UZV7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UZV7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UZV7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UZV7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UZV7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UZV7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UZV7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UZV7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms