Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnpc3Q3UZ01 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnpc3Q3UZ01 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnpc3Q3UZ01 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnpc3Q3UZ01 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnpc3Q3UZ01 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms