Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms