Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rmi2Q3UPE3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rmi2Q3UPE3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rmi2Q3UPE3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rmi2Q3UPE3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rmi2Q3UPE3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rmi2Q3UPE3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rmi2Q3UPE3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmi2Q3UPE3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmi2Q3UPE3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rmi2Q3UPE3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms