Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdgfl2Q3UMU9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdgfl2Q3UMU9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hdgfl2Q3UMU9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdgfl2Q3UMU9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdgfl2Q3UMU9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdgfl2Q3UMU9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdgfl2Q3UMU9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms