Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc106Q3ULM0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc106Q3ULM0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc106Q3ULM0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc106Q3ULM0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc106Q3ULM0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms