Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc177Q3UHB8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc177Q3UHB8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc177Q3UHB8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc177Q3UHB8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc177Q3UHB8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc177Q3UHB8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms