Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGF1

Wdr19, WD repeat-containing protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr19Q3UGF1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdr19Q3UGF1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdr19Q3UGF1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdr19Q3UGF1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Wdr19Q3UGF1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Wdr19Q3UGF1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Wdr19Q3UGF1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Wdr19Q3UGF1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Wdr19Q3UGF1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr19Q3UGF1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr19Q3UGF1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr19Q3UGF1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr19Q3UGF1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr19Q3UGF1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdr19Q3UGF1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdr19Q3UGF1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Wdr19Q3UGF1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Wdr19Q3UGF1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Wdr19Q3UGF1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Wdr19Q3UGF1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Wdr19Q3UGF1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Wdr19Q3UGF1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdr19Q3UGF1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdr19Q3UGF1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdr19Q3UGF1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdr19Q3UGF1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdr19Q3UGF1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Wdr19Q3UGF1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Wdr19Q3UGF1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Wdr19Q3UGF1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Wdr19Q3UGF1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Wdr19Q3UGF1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Wdr19Q3UGF1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdr19Q3UGF1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdr19Q3UGF1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdr19Q3UGF1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Wdr19Q3UGF1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Wdr19Q3UGF1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Wdr19Q3UGF1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Wdr19Q3UGF1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Wdr19Q3UGF1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Wdr19Q3UGF1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Wdr19Q3UGF1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Wdr19Q3UGF1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdr19Q3UGF1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdr19Q3UGF1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdr19Q3UGF1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Wdr19Q3UGF1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdr19Q3UGF1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Wdr19Q3UGF1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Wdr19Q3UGF1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Wdr19Q3UGF1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Wdr19Q3UGF1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Wdr19Q3UGF1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Wdr19Q3UGF1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Wdr19Q3UGF1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Wdr19Q3UGF1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Wdr19Q3UGF1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Wdr19Q3UGF1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms