Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trafd1Q3UDK1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trafd1Q3UDK1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trafd1Q3UDK1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trafd1Q3UDK1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trafd1Q3UDK1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trafd1Q3UDK1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trafd1Q3UDK1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trafd1Q3UDK1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trafd1Q3UDK1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trafd1Q3UDK1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trafd1Q3UDK1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trafd1Q3UDK1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trafd1Q3UDK1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trafd1Q3UDK1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trafd1Q3UDK1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trafd1Q3UDK1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trafd1Q3UDK1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms