Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
InipQ3TXT3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
InipQ3TXT3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
InipQ3TXT3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
InipQ3TXT3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
InipQ3TXT3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
InipQ3TXT3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
InipQ3TXT3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
InipQ3TXT3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
InipQ3TXT3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
InipQ3TXT3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
InipQ3TXT3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms