Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srsf6Q3TWW8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srsf6Q3TWW8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srsf6Q3TWW8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srsf6Q3TWW8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srsf6Q3TWW8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srsf6Q3TWW8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srsf6Q3TWW8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srsf6Q3TWW8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srsf6Q3TWW8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srsf6Q3TWW8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srsf6Q3TWW8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srsf6Q3TWW8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srsf6Q3TWW8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srsf6Q3TWW8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srsf6Q3TWW8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srsf6Q3TWW8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srsf6Q3TWW8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srsf6Q3TWW8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srsf6Q3TWW8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Srsf6Q3TWW8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srsf6Q3TWW8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srsf6Q3TWW8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srsf6Q3TWW8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srsf6Q3TWW8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srsf6Q3TWW8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Srsf6Q3TWW8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srsf6Q3TWW8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Srsf6Q3TWW8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srsf6Q3TWW8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srsf6Q3TWW8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srsf6Q3TWW8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srsf6Q3TWW8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srsf6Q3TWW8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srsf6Q3TWW8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srsf6Q3TWW8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srsf6Q3TWW8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms