Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
9130409I23RikQ3TS87 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
9130409I23RikQ3TS87 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
9130409I23RikQ3TS87 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
9130409I23RikQ3TS87 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
9130409I23RikQ3TS87 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
9130409I23RikQ3TS87 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
9130409I23RikQ3TS87 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
9130409I23RikQ3TS87 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
9130409I23RikQ3TS87 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
9130409I23RikQ3TS87 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
9130409I23RikQ3TS87 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
9130409I23RikQ3TS87 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
9130409I23RikQ3TS87 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
9130409I23RikQ3TS87 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
9130409I23RikQ3TS87 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
9130409I23RikQ3TS87 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
9130409I23RikQ3TS87 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
9130409I23RikQ3TS87 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
9130409I23RikQ3TS87 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
9130409I23RikQ3TS87 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
9130409I23RikQ3TS87 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
9130409I23RikQ3TS87 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
9130409I23RikQ3TS87 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
9130409I23RikQ3TS87 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
9130409I23RikQ3TS87 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
9130409I23RikQ3TS87 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
9130409I23RikQ3TS87 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
9130409I23RikQ3TS87 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
9130409I23RikQ3TS87 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
9130409I23RikQ3TS87 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
9130409I23RikQ3TS87 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
9130409I23RikQ3TS87 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
9130409I23RikQ3TS87 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
9130409I23RikQ3TS87 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
9130409I23RikQ3TS87 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
9130409I23RikQ3TS87 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
9130409I23RikQ3TS87 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
9130409I23RikQ3TS87 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
9130409I23RikQ3TS87 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
9130409I23RikQ3TS87 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
9130409I23RikQ3TS87 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms