Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf3c3Q3TMP1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtf3c3Q3TMP1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms