Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdlim7Q3TJD7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdlim7Q3TJD7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdlim7Q3TJD7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdlim7Q3TJD7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdlim7Q3TJD7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdlim7Q3TJD7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdlim7Q3TJD7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdlim7Q3TJD7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdlim7Q3TJD7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdlim7Q3TJD7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdlim7Q3TJD7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdlim7Q3TJD7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdlim7Q3TJD7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdlim7Q3TJD7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdlim7Q3TJD7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdlim7Q3TJD7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdlim7Q3TJD7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdlim7Q3TJD7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdlim7Q3TJD7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdlim7Q3TJD7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdlim7Q3TJD7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdlim7Q3TJD7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdlim7Q3TJD7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pdlim7Q3TJD7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdlim7Q3TJD7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdlim7Q3TJD7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdlim7Q3TJD7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdlim7Q3TJD7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdlim7Q3TJD7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdlim7Q3TJD7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdlim7Q3TJD7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pdlim7Q3TJD7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdlim7Q3TJD7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdlim7Q3TJD7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdlim7Q3TJD7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdlim7Q3TJD7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdlim7Q3TJD7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdlim7Q3TJD7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdlim7Q3TJD7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdlim7Q3TJD7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdlim7Q3TJD7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdlim7Q3TJD7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdlim7Q3TJD7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdlim7Q3TJD7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms