Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

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Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap5b1Q3TAP4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap5b1Q3TAP4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap5b1Q3TAP4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap5b1Q3TAP4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap5b1Q3TAP4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap5b1Q3TAP4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap5b1Q3TAP4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap5b1Q3TAP4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap5b1Q3TAP4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap5b1Q3TAP4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap5b1Q3TAP4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap5b1Q3TAP4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ap5b1Q3TAP4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ap5b1Q3TAP4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ap5b1Q3TAP4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ap5b1Q3TAP4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ap5b1Q3TAP4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ap5b1Q3TAP4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap5b1Q3TAP4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap5b1Q3TAP4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ap5b1Q3TAP4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ap5b1Q3TAP4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap5b1Q3TAP4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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