Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd8Q3TA59 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd8Q3TA59 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd8Q3TA59 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Jmjd8Q3TA59 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Jmjd8Q3TA59 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms