Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col24a1Q30D77 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col24a1Q30D77 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col24a1Q30D77 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col24a1Q30D77 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col24a1Q30D77 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Col24a1Q30D77 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col24a1Q30D77 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col24a1Q30D77 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col24a1Q30D77 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Col24a1Q30D77 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col24a1Q30D77 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Col24a1Q30D77 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col24a1Q30D77 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col24a1Q30D77 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col24a1Q30D77 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col24a1Q30D77 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col24a1Q30D77 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col24a1Q30D77 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col24a1Q30D77 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col24a1Q30D77 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col24a1Q30D77 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col24a1Q30D77 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col24a1Q30D77 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col24a1Q30D77 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col24a1Q30D77 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col24a1Q30D77 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Col24a1Q30D77 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col24a1Q30D77 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col24a1Q30D77 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col24a1Q30D77 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col24a1Q30D77 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col24a1Q30D77 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col24a1Q30D77 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col24a1Q30D77 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col24a1Q30D77 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col24a1Q30D77 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col24a1Q30D77 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col24a1Q30D77 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col24a1Q30D77 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Col24a1Q30D77 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col24a1Q30D77 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col24a1Q30D77 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col24a1Q30D77 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col24a1Q30D77 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col24a1Q30D77 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col24a1Q30D77 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col24a1Q30D77 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col24a1Q30D77 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col24a1Q30D77 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col24a1Q30D77 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col24a1Q30D77 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col24a1Q30D77 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col24a1Q30D77 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col24a1Q30D77 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col24a1Q30D77 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Col24a1Q30D77 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms